人类文明高度发达的未来城市休特尔比尔特，生活着一群拥有特殊能力的人群，他们被人称作“Next”。在这个物欲横流、罪行多发的堕落年代，Next们凭借自己卓越的能力扮演起正义战士的角色，当然现实生活中他们必须养家糊口，于是帅气拉风的铠甲上印满了赞助商的商标。为这一切推波助澜 的，是一档名为HeroTV Live的真人秀节目，制片方跟踪直播每一位英雄的正义行动，并根据他们的表现排名，定期评选出“King of Hero”。人气滑落的Wild Tiger镝木·T·虎彻（平田广明 配音）是一个为了抓捕罪犯不惜破坏公物的鲁莽战士，正值此时，他被安排和人气飙升的巴纳比·布鲁克斯·Jr.（森田成一 配音）组队。 两个性格完全不同的正义战士，在这个商业气息极浓的社会里将擦出怎样的火花？

楠木赖子（高桥美佳子 配音）是个14岁的初中生，在班上没什么朋友，但偶然得到班上极为耀目的美少女柚木加菜子（戸松遥 配音）的青睐，两人成为朋友，不料相约乘电车去看湖时飞来横祸，加莱子落下站台被列车轧成重伤。刑警木场修太郎（关贵昭 配音）调查此案，发现加莱子似乎有着神秘的重要身 份，同时以多摩为中心，整片地区陆续发现许多被分尸的尸体残块，关注整个事件的中禅寺敦子（桑岛法子 配音）、关口巽（木内秀信 配音）、鸟口守彦（浪川大辅 配音）为了写出内幕报道，调查中在森林中发现古怪建筑物，如巨大的匣子，一切谜底的最终还要靠京极堂（平田広明 配音）揭开……

宇宙殖民地移民经过数百年的宇宙时代，争夺地球圈霸权的战争结束了，本以为和平的时代已经来临，然而却是快要面临着崩毁。 A.G.（Advanced Generation）101年 突如其来的不明敌人（UE=Unknown Enemy）攻击宇宙殖民地“天使”并使其崩毁，这死伤惨重的悲剧日后被称为“天使的日落”，之后UE对居住在地球圈的人们带来长期的危害。 A.G.108年 与UE的战斗持续着，原本和平的宇宙殖民地“奥凡”也遭到袭击，居住在此的7岁少年弗里特·明日野在战火中失去了母亲。不过，母亲在临终时，将家中代代相传的记忆单元“AGE装置”托付给他。其中包含着被称为救世主的古代MS“高达”的设计图，弗利特继承了母亲的意志，决心造出高达。 A.G.115年 14岁的弗利特被宇宙殖民地“诺拉”的联邦军基地阿林斯顿接收。七年间，和基地的工程师们持续着研究，终于完成了高达。这部搭载了“AGE系统”的高达，能够令机体自我进化。 然而，可怕的时刻终于来临…… UE的魔爪终于逼近和平的殖民地“诺拉”。 如今，弗利特开动自己制造的高达，挺身而战。 到底弗利特能战胜14年间都不能战胜的可怕敌人UE吗？ 历经明日野家族3代人的“百年战争”由此展开……

此番的新故事以马林梵多的顶上战争结束后为原点，描绘了失去艾斯并与同伴们分离的岁月里，主人公路飞在鲁斯卡纳岛上修行习得霸气的故事，而西鲁巴兹·雷利、波雅·汉库克、巴基、佩罗娜等角色也将登场亮相。此外，剧中还会出现由尾田新绘制的敌人——恶魔果实持有者班迪·沃尔德。

自西元20XX年，人类从肯亚图尔卡纳湖的湖畔挖出了一个名叫索哈尔(Zohar)的物体之后，便开始对它进行研究，后来有人重建出来所谓的“神之语言”，并建立电脑程式以启动原始索哈尔，进行和上位领域的U-DO(上位领域当中的红色波动存在)连结的连结实验，但很不幸地，从上位领域流入下位领域的能量造成了事象变移，使地球(游戏中所谓的“失落耶路撒冷”)几乎完从从宇宙中“消失”，人类因而被迫逃亡，离开地球。 到了四千年多后，在故事开始前十五的T.C.4753年，米尔奇亚行星(Miltia)爆发了所谓的米尔奇亚冲突事件，在此次事件当中，米尔奇亚行星的人类疑似遭到了格诺西斯(Gnosis)的攻击，并在冲突事件后消失，但事件的真相却因为米尔奇亚的消失而不为人知。在事件后，启动原始索哈尔（后来人类制造出了十二具索哈尔模拟体，因此原有的索哈尔就被称之为原始索哈尔）所需的神之语言、原始索哈尔的研究成果、米尔奇亚的U.M.N.座标等事物，都被封存在Y资料当中，而Y资料又被封存在百式观测用合成人(Relian)M.O.M.O.的意识内，然而这么做却引起了各方势力对M.O.M.O.的争夺，因此星团联邦政府(游戏中统治各行星的政府，英文名Galaxy Federation)雇了一个名叫Ziggurat 8的生化人(Cyborg)，以保护M.O.M.O.的安全。 另一方面，在米尔奇亚冲突事件结束后的十几年，也就是大约在游戏EPI开始的时候，当时最大的企业贝克达公司以对抗格诺西斯侵扰的名义，进行对格诺西斯用战斗兵器KOS-MOS的开发计划，但和当时多使用合成人(Relian)与生化人(Cyborg)的情况所不同的是，KOS-MOS是个纯粹的机械制品。另一方面，在EPI开始时，参与KOS-MOS开发计划的贝克达公司第一开发局研究人员卯月紫苑，正乘着当时载有还没正式启动的KOS-MOS的Woglinde号太空船进行旅途。但没想到其太空船却被冲著索哈尔而来的格诺西斯所攻击，而KOS-MOS也在此时突然启动，卯月紫苑因而被卷入一连串和格诺西斯及索哈尔有关的阴谋，以及会改变人类命运的事件当中……

这里是人、神、魔等种族共同生活的神秘世界，密斯塔尔希亚 过去，黑银之翼的巴哈姆特曾几乎令这个世界毁灭 但人，神，魔三族共同战斗 作出了巨大的牺牲后，终于把它的力量封印了起来 接着，神与魔两方分别保存着封印钥匙的一半 二千年以后，世界始终和平安宁 不知从什么时候起，人类将巴哈姆特当作了独一无二的尊贵存在，畏惧并崇拜它 某一天 一位少女夺走了保护严密的神族的钥匙 世界的均衡渐渐被打破 当巴哈姆特再次发出吼声之时 世界再次落入绝望的深渊 世界啊，毁灭吧！ 某个声音如此肯求着

始主魔神创造了世界，追之有了火，水，木等魔神，而魔神又创造出骨。龙之骨是地球的守护之骨。身为一个平凡高中生的龙神翔悟，突然遭到了神秘敌人“黑暗战士”的袭击，而其目的就是为了获得“骨之卡”。而后，翔悟等年轻人开始肩负起了守护地球，并使用骨之卡变身成为“骨之战士”的使命。为何会有骨之卡？黑暗战士的真身究竟是什么？魔神又是怎样的存在？全新的传说，就此开始！

一年战争已告一段落的三年后，基于地球联邦军重建计划而被提议的“高达开发计划”开始执行，其中的两台原型机RX-78GP01与RX-78GP02A为了实施性能测试而搬运至澳大利亚"托林顿"基地，但是吉恩残党查知此项计划，并且袭击该基地企图夺取装载有核弹的GP02A。曾经被称呼为“所罗门的恶梦”的吉恩军王牌机师阿纳贝尔•卡多少校（又译为阿纳贝鲁•卡图）成功的搭上了GP02A，但是在企图脱离的GP02A面前，新手测试驾驶员浦木宏驾驶了GP01拦阻，揭开了宇宙世纪0083年迪拉兹纷争的序幕。

阿斯特拉金斯银河一直以来分为两大星系——Girugames星系和Rose Land星系。这两大星系之间，已经经历了一百多年未间断的战争……

这个世界称之为阿斯提尔，在这个世界的中心，插着一把高耸入云的巨剑“大地之剑”。这是对想入侵这个世界的邪龙族的一个结界封印。每隔一千年，这个封印的力量都会达到一个低潮，邪龙族也会在此时进行侵略，而每到这个时候，大陆上都会出现驾驭着生命体机甲“龙”而与邪龙族进行战斗的勇士。而在这个故事的开端，这一千年的时限又迫近了…… 亚迪，本故事的男主角，是一个孤儿，但小时候就被身为海盗的养父收养，一次和姐姐（养父的女儿）在丛林里玩耍时，无意中看见了一个神秘的龙骑士与怪物的战斗，从此立下了成为最强大骑士的目标。在某一天的修行中，遇见一位老人，老人送给他一张卡片，并教导亚迪如何将卡片中的龙骑士召唤出来，在老人离开前说，想要成为骑士中的骑士，那就向大地之剑出发吧。为此，亚迪踏上了前往大地之剑的旅程。 在旅途的过程中，亚迪结识了魔法使柏菲（驾驶着龙法师）、僧侣伊兹米（驾驶着龙僧侣）、忍者猿飞（驾驶着龙忍者）等人，在同伴不断增加的旅途中，也遇上了自己的宿敌，黑骑士嘉鲁登（驾驶着黑暗龙骑士），并不断遇上不同程度的危险。最后，众人团结一心，在大地之剑上与邪龙族战斗并成功击溃了邪龙王，保护了这个世界。

故事发生在一年战争期间，正和初代高达的故事平行。到地球战线赴任的年轻联邦军官斯罗·亚玛达，在一次偶然的交火中，结识了敌人、也就是吉恩军的女驾驶员爱娜·萨哈林。这一对互相抱有好意的年轻人，因为正属于敌对的两方，所以不得不互相战斗，在战争中苦苦维持自己的感情；另一方面，斯罗和他所带领的、第08MS小队的队员们，也在不断的战斗中逐步培养起友谊和信赖。

时间是1968年，当学生运动愈演愈烈之际，某大学的医学部出现了一个奇怪的男子。他有着黑白相间的头发，全身到处都是伤痕，而带着伤疤的脸也成为注册商标。这个男人为了获得医师资格证而学习，他的名字是间黑男，并且他通过自己天才的能力，创造了无数的奇迹。并且被后人称为黑杰克。