宇宙移民与宇宙战争的历史—宇宙世纪终结后，时光飞逝，人们迎来新的历史Regild Century(R.C.)，并开始了繁荣与和平的生活。 RC1014年，耸立大地连接地球和宇宙的轨道天梯Capital Tower(首都塔)，从宇宙中为人类带来作为地球能量之源的Photon Battery，故被视为是圣地。 其守护组织Capital Guard候补生贝尔利·杰纳姆在初次飞行的时候遭到所属不明MS G-SELF的攻击。贝尔利使用维修检查用MS与其交战并成功捕获。 然而贝尔利对G-SELF的驾驶者，名为アイーダ・レイハントン的宇宙海贼少女产生了某种感觉。 不满足特定条件便不会启动的G-SELF对贝尔利产生了某种反应。 宇宙海贼和アイーダ的目的、被G-SELF选中的贝尔利的命运、令RC全体动摇的真相——这一切只不过是Reconguista的开始。

真历17年，第三银河帝国正式创立。地球上占七成人口实现外星移民，而人类社会也分裂成幼军政府成立的多尔西亚军邦和扩大贸易协定的环大西洋条约组织ARUS。两大势力此消彼长，纷争不断。在此期间，崇尚和平的中立国家迪奥尔独善其身，却不免被卷入战火的命运。在平静的一天，迪奥尔星遭 到多尔西亚突袭。性情温和的少年时缟晴人（逢坂良太 配音）目睹心仪的女孩指南翔子（濑户麻沙美 配音）被炮火埋葬，悲愤之际登上了意外从校舍下方突出地面的神秘机器人Valvrave，并以雷霆万钧之势击败对手。在此之后，晴人被世人奉为偶像和英雄，但他的身体也发生奇怪突变，一度和多尔西亚的一人旅团少年艾尔艾尔弗（木村良平 配音）交换身体。 战火并未就此停止，多尔西亚的攻势仍在继续，而Valvrave的秘密还未完全揭开……

人类文明高度发达的未来城市休特尔比尔特，生活着一群拥有特殊能力的人群，他们被人称作“Next”。在这个物欲横流、罪行多发的堕落年代，Next们凭借自己卓越的能力扮演起正义战士的角色，当然现实生活中他们必须养家糊口，于是帅气拉风的铠甲上印满了赞助商的商标。为这一切推波助澜 的，是一档名为HeroTV Live的真人秀节目，制片方跟踪直播每一位英雄的正义行动，并根据他们的表现排名，定期评选出“King of Hero”。人气滑落的Wild Tiger镝木·T·虎彻（平田广明 配音）是一个为了抓捕罪犯不惜破坏公物的鲁莽战士，正值此时，他被安排和人气飙升的巴纳比·布鲁克斯·Jr.（森田成一 配音）组队。 两个性格完全不同的正义战士，在这个商业气息极浓的社会里将擦出怎样的火花？

宇宙殖民地移民经过数百年的宇宙时代，争夺地球圈霸权的战争结束了，本以为和平的时代已经来临，然而却是快要面临着崩毁。 A.G.（Advanced Generation）101年 突如其来的不明敌人（UE=Unknown Enemy）攻击宇宙殖民地“天使”并使其崩毁，这死伤惨重的悲剧日后被称为“天使的日落”，之后UE对居住在地球圈的人们带来长期的危害。 A.G.108年 与UE的战斗持续着，原本和平的宇宙殖民地“奥凡”也遭到袭击，居住在此的7岁少年弗里特·明日野在战火中失去了母亲。不过，母亲在临终时，将家中代代相传的记忆单元“AGE装置”托付给他。其中包含着被称为救世主的古代MS“高达”的设计图，弗利特继承了母亲的意志，决心造出高达。 A.G.115年 14岁的弗利特被宇宙殖民地“诺拉”的联邦军基地阿林斯顿接收。七年间，和基地的工程师们持续着研究，终于完成了高达。这部搭载了“AGE系统”的高达，能够令机体自我进化。 然而，可怕的时刻终于来临…… UE的魔爪终于逼近和平的殖民地“诺拉”。 如今，弗利特开动自己制造的高达，挺身而战。 到底弗利特能战胜14年间都不能战胜的可怕敌人UE吗？ 历经明日野家族3代人的“百年战争”由此展开……