该剧以伊豆国豪族北条时政的次子、镰仓幕府第2代执权北条义时成为日本实际执政者的故事。该剧得名于镰仓幕府设置的十三人合议制。

未来世界科技高度发达，星际旅行不再是梦想。在木星和土星之间曾有一个繁荣一时的空间殖民地“涡潮”，从地球专门有一条名为246666号公路的银河街道通往殖民地。不过在通车150年后，银河街道渐渐衰落，面临废除的命运。在这条路上，有一条小小的汉堡店，由极度热爱汉堡的店长诺亚（香取慎吾 饰）和妻子诺厄（绫濑遥 饰）共同经营。最近，诺亚怀疑妻子有外遇，为此忧心忡忡。这一天，诺亚的旧爱（优香 饰）带着怪异的丈夫（梶原善 饰）出现，让诺厄心中升起不安。与此同时，形形色色的人等相继来到店里，有的渴望来一次太空艳遇，有的决定吐露心中的秘密，有的执着追求诺厄，有的则被奇怪的幻觉困扰。 在这条被许多人渐渐遗忘的街道上，可爱的故事交替上演……

天正十年，爆发了左右日本战国史的最重要事件——本能寺之变，第六天魔王织田信长（筱井英介 饰）霸业梦断。他的属下在继承信长遗志的同时，也展开了关于继承者的明争暗斗。丹羽长秀（小日向文世 饰）和笔头家老柴田胜家（役所广司 饰）主推信长的三子信孝（坂东巳之助 饰）；另一方是讨伐光秀而声名鹊起的猴子羽柴秀吉（大泉洋 饰），他在军师黑田官兵卫（寺岛进 饰）辅佐下力推信长的次子信雄（妻夫木聪 饰）。双方各自争取信长的妹妹阿市（铃木京香 饰）的支持，同时争取一切可以争取到的力量。 决定历史走向的清须会议召开在即，谁才是最终的胜者？

相河一辉（高桥一生饰）在大学教授研究动物行为的“动物行为学”，半年前刚开始讲师的生活，但是他太喜欢各种生物，沉迷于研究，甚至不遵守大学的规则，每天都在职场挨批，而且他不太遵守时间，还被牙医吐槽没常识。一辉非常诚实，有时对学生的提问直接回答不知道，让学生困惑，他坚持兴趣，不守固定观念的样子也影响了身边人的价值观。

名侦探胜吕武尊（野村万斋 饰）在休假时到访的熊野古道酒店，听到了与当时不相称的不安的话。事件在这个时候已经开始行动了。第二天，为了吃早饭胜吕武尊去了酒店的休息室，看到了在那里读医学书的医生沙罗绢子（比嘉爱未 饰）的身影，打了招呼。这时，本堂家的夫人（松坂庆子 饰）、次子主水（市原隼人饰）、长女镜子（堀田真由 饰）、次女绚奈（原菜乃华 饰）来了。营造出一种异样氛围的夫人，一来就大骂酒店的工作人员，开始对孩子们下各种命令。稍晚的时候，长子礼一郎（山本耕史饰）和妻子凪子（西尔维亚·格拉夫 饰）也来了。夫人的言行简直就像一家独裁者，孩子们都完全处于她的支配之下。胜吕被那个奇怪家族的情况搞得目瞪口呆。据和一家有着长久交往的男子·十文字幸太（坪仓由幸 饰）说，主要是本堂氏留下足够的钱，可以让这家人一辈子玩下去，最后死去，所以此时本堂家全家都在日本旅行。在沙罗的邀请下，胜吕访问了本宫大社。回头一看，是女议员上杉穗波（铃木京香 饰）和编辑飞鸟花（长野里美 饰）。胜吕在穂波面前露出了从未见过的表情。 两天后，本堂一家和胜吕、沙罗、穗波、飞鸟乘坐包租巴士前往古道散步。被称为灵峰的熊野有很多神秘的山路，景色也很神秘。而且，自古以来天狗的目击故事也源源不断。每个人都在各自想去的地方度过时光。在这种情况下，本应在参道沿岸的长椅上休息的本堂夫人，被发现成了尸体。胜吕被当地警察署长·川张大作（阿南健治 饰）请求解决案件，于是立刻开始搜查。虽然夫人平时心脏就很弱，但是胜吕在他的右臂上发现了注射针之后。是病死吗？是被谁杀了吗？胜吕在到达酒店的晚上，突然想起了偶然听到的话。“不知道吗？这样的话就只能杀了”。那个声音究竟是谁？和夫人的死有关系吗？家里所有人都有动机，有机会杀害所有人。名侦探胜吕史上最复杂的案件的推理，就是这样开始了。