该片讲述了男女主角被卷入一个巨大的科研阴谋，在一步步揭露谜团的过程中，两人不得不面对爱情、欺骗、阴谋、背叛等，在以为已经窥视到阴谋的全貌时，却又发现，这一切只是冰山一角……

距离明堂大礼只有一天的时间，南宋都城临安府内突发命案，民众纷纷传言是夜游神又来惩奸除恶了。只有一天的破案时间，案件又如此扑朔迷离，京城临安府府尹夏侯言决定请来一名奇人相助，名曰宋慈。夏侯言立即修书一封，快马送出。 宋慈数年前参加科考，得中进士。却因其父身体原因，不得不放弃官衔，留守家中以尽孝道。这日，一封书信被快马加鞭送到了宋慈手上。信件中的案情描述让宋慈坐立不安，面对反对的声音，宋慈以国家大义为重，力排众议，决定独自前往临安，为国家排忧解难，破案抓凶。

赛车手林闯爱慕竞争对手梁梓，一次沙漠赛事，梁梓半途主动退出，林闯不明所以但追随前去。不料二人途中却遭遇地下神秘沙蟒袭击，一路逃至附近的废弃工厂，发现富商熊坤正在此地进行稀有矿物勘探，他正是从生物博士姜聪手里买下这块地。种种线索显示，神秘沙蟒、失踪父亲、废弃工厂之间有着紧密联系。这时众人发现地下暗藏着更多的巨型沙蟒。荒芜之地，人与兽在斗，人与人之间也在斗。

一场百年罕见的蝗灾侵袭了武周大地，武则天下令送赈灾银往灾区，却在途中被劫，数万两白银竟化蝶消失！狄仁杰命其亲随赵员镇奉命彻查此案，自己微服潜入民间调查。在查案的过程中他们遇到了需自证清白的嫌疑人官小柒，又陷入了赈灾银再次被劫的困窘之境。灾民民怨四起，化蝶案扑朔迷离，朝堂权谋暗潮汹涌，狄仁杰是否能查清真相，天下又是否能重回太平？

分集剧情 梵花飞尸案 勾栏院中飞尸陨落，尸身布满诡异绮丽的枝蔓状花纹。锦衣卫指挥史离奇暴毙，京城再掀梃击恐怖…… 无间浮屠案 新帝登基，阴云遮日，佛像霎时青光遍体，沁血如泪。似天降不祥之气，众人惊恐之声响彻大殿…… 魑魅夜游案 科举盛事，八方才子集聚京师，觥筹交错之时，探花身中数刀惨死，状元呓语惊人，城中诡影频现，似故人索命。朝堂市井，惶惶不得终日…… 飞火燃灯案 花灯佳节，酒酣之时，观景台上，一人口中喷涌出青绿色烈焰，瞬时火焰蔓延全身，整个人成雄雄燃烧之势，坠落之时，一触即发，城中数人顷刻间身道异处…… 萧墻之殇案 宫中旧人，接连殒命，疑犯无迹可寻。凶案频起，欲与重明卫叫嚣。“尸音”扑朔迷离，三人组生死成谜……