六年级的小学生进藤光（川上友子 配音）无意中翻出了爷爷家的旧棋盘。触碰棋盘的一瞬间也释放出了寄居在其上的平安时代棋士藤原佐为（千叶进步 配音）的灵魂。附身于小光体内的佐为视棋如命，小光在其软磨硬泡下开始下围棋，接触了一批厉害的棋士，其中不乏他的同龄人。小光开始对围棋产生兴趣并展现了他的天分，而佐为则成为了小光的秘密老师…… 《棋魂》改变自堀田由美的同名作品，漫画由小畑健执笔，并由日本棋院的女棋士梅泽由香里担当监修。当年上映引起轰动后，引发了一股学习围棋的热潮，借由佐为的附身改变了主人公进藤光，讲述了其棋艺和心灵的成长，也在其中普及了围棋知识，意义深远。

故事发生在钟之音学园中，数百年来，这所学园都只允许女性踏足，是男性们的禁地，但随着时代的发展和进步，人们的观念也在发生着变化，终于，钟之音学园打开了校门，开始招收男性学生，这一消息让整天都和同性待在一起的女生们不禁兴奋满满，对于究竟是怎样的人将成为她们的同僚感到十分好奇。、 高崎佑介（武内健 配音）是第一批进入学校就读的学生之一，然而他却并不是女孩子们所想象的那样文质彬彬，正相反，他有着非常不堪的黑历史！高崎的出现带给了千岁绿（中山真奈美 配音）不一样的感觉，这种奇异的感觉源自几千年前的一个传说。