米妮（梁咏琪 饰）是海关督察，近日里，她获得消息，得知大量毒品即将抵达香港，于是决心调查此案，然而却遭到了毒贩“冰后”强大的火力抵抗，败下阵来。飞虎队队长王东（王敏德 饰）带领队员们进驻海关，王东更是坦言海关方面根本不是毒贩的对手，这让米妮感到十分愤怒。 米妮卯足了劲想要攻破此案，然而对手阴险狡诈冷酷无情，米妮带领的队伍屡屡遭受重创，米妮的莽撞举动令上司大为不满，然而将这一切都看在眼里的王东却对她的胆识和毅力十分敬佩，在飞虎队的帮助下，众人攻破了毒贩藏身的仓库，却遭到了另一波神秘人马的伏击，一向所向披靡的飞虎队受到了灭顶的打击。

20年代末，为完成师父的志愿，陈真（李连杰 饰）到东洋学先进技术，他喜欢着日本女孩山田光子（中山忍 饰）。因为师父霍元甲之死，陈真回到中国，协助师父之子霍廷恩（钱小豪 饰）主持精武门的业务，不料却引起了他的妒忌，师兄弟之间引发权力之争。 另一方面，陈真追查师父死因，怀疑是日军 军官藤田刚（周比利 饰）暗中使用慢性毒药杀死霍元甲。陈真请医生验尸，证实师父确系中毒而死。藤田刚恐阴谋败露，杀人嫁祸，展开了连场恶斗。不久，藤田刚挑战精武门，他诱使日本黑龙会总教头船越文夫向精武馆挑战。比武之日，双方开展了一场惊心动魄的决战。

缉毒总督察李振邦（张家辉 饰）和卧底警员江铭（陈伟霆 饰）秘密执行追捕毒贩计划，无奈遭遇险境，江铭被迫游走黑白边缘，逐渐失控。为坚守底线，昔日队友互生杀意。猜忌、愤怒、疯狂、失望……全员丧失理智，濒临崩溃边缘！