自从七原秋也与中川典子从新世纪教育法（简称BR）中逃出，两年转眼就过去了。人类社会进入了恐怖主义时代！首都在反BR国家的恐怖分子的袭击下，化为一片废墟。政府当局认定凶犯为七原秋也，开始了对其国际通缉。 七原作为反BR组织“wild seven”的精神领袖，对所有成人发出 了宣战通告。成人为了剿灭七原，发起了一个新游戏——BR2。又一个高中班被军队绑架到荒岛，他们无一例外地被勒令换上军队制服，稍有不从下场就只有死亡！又一场血腥、残忍、惨无人道的大逃杀开始了！ 本片为《大逃杀》的续集，导演深作欣二在开机伊始便病倒，不久病故，其后的拍摄工作由他的儿子深作健太担任。

高中女生奈绪（名冢佳织 配音）隶属摄影部，她喜欢捕捉云和风。一天，她在学校天台拍照时，看见一只飞天猫，随即天空居然下起了“猫雨”，震惊之余她不慎失足坠楼。出乎意料的是，从高空中摔下的她竟毫发无损。原来是拥有操纵风的能力的风使——大气老师救了她，而那只猫之所以会飞也是因为它懂得操纵风。得知大气老师回乡参加祭典后，奈绪和好朋友美纪（花村怜美 配音）以及同班男生阿润（入野自由 配音）一起来到风使之乡找他，向他学习风的知识，老师却一口回绝。目睹了震撼人心的风之祭典后，奈绪似乎更加了解风…… 本动画围绕着奈绪的日常展开，她的高中生活也许平平凡凡，然而故事里有风。

某天，一群来自Picto星球的外星人莅临地球，他们心怀叵测，发誓要将所有的地球人变成野篦坊（日本民间传说中没有五官通体白色的妖怪），进而吞并全银河系最为落后的地球。危机当前，美国（小西克幸 配音）、英国（杉山纪彰 配音）、法国（小野坂昌也 配音）、俄罗斯（高户靖广 配音）、德国（安元洋贵 配音）、意大利（浪川大辅 配音）等曾经势不两立的大国放下芥蒂，虽然争吵不断，但还是决心和外星入侵者决一死战。各国派出自己最高精尖的武器和军队，可是全部被Picto星人白化。形势愈演愈烈，各国只好深入虎穴，闯入对方的飞碟母舰中…… 本片根据同名漫画改编，为该动画片的剧场版。

为了培养出忠实效忠于成人、在逆境中坚忍不拔的青少年一代，日本政府出台《BR》法案。每年都从全国学校随机抽出一个班级的同学，前往荒岛进行生存极限挑战——老师发给学生地图、粮食和各式武器，令他们自相残杀，直到存活下来的最后一个，才能离开荒岛。接下来，残酷的游戏规则和令人绝望的生存条件，使班级里的年轻人开始了相互杀戮。善良或者凶残，主动出击或者被动防守， 同学们开始了各自的计划，人性的丑恶在血腥的死亡中暴露无遗。 大逃杀的游戏在荒岛上壮烈上演。究竟学生们的宿命如何，谁才是最后的存活者。